More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0930 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  96.63 
 
 		 178 aa  360  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  96.63 
 
 		 178 aa  356  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  94.38 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  93.82 
 
 		 178 aa  347  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  90.45 
 
 		 178 aa  338  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 184 aa  308  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 176 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 		 183 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 		 183 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  82.49 
 
 		 183 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 		 183 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 		 209 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 		 209 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 		 209 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  81.03 
 
 		 176 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  63.53 
 
 		 193 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  64.12 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  63.53 
 
 		 193 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 194 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 		 198 aa  210  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 200 aa  208  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  57.39 
 
 		 204 aa  205  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 		 187 aa  205  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  61.35 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 		 177 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  54.07 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  61.49 
 
 		 192 aa  195  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  36.05 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  40.62 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  32.59 
 
 		 283 aa  74.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  39.55 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  30.15 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  34.43 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  31.03 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 293 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  34.29 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  33.33 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  31.29 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  32.8 
 
 		 326 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  30.77 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 317 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 323 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  32.26 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  31.43 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  30.95 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  31.62 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  33.58 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 298 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  30.46 
 
 		 303 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>