More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1315 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  93.75 
 
 		 176 aa  340  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  82.18 
 
 		 178 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  81.03 
 
 		 178 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  81.03 
 
 		 178 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  79.89 
 
 		 178 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 178 aa  298  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 178 aa  297  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  80.57 
 
 		 178 aa  297  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  78.03 
 
 		 184 aa  284  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  77.59 
 
 		 209 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  77.59 
 
 		 209 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  77.59 
 
 		 209 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  77.59 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  77.59 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  77.59 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  77.59 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  62.94 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  62.94 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  62.35 
 
 		 193 aa  223  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 		 194 aa  220  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  57.23 
 
 		 198 aa  210  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  56.8 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  57.4 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  57.8 
 
 		 180 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  58.18 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  32.93 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  41.67 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  40.15 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  28.81 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  35.81 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 265 aa  67.8  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 382 aa  67  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  34.06 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  31.58 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  29.1 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  30.86 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  31.75 
 
 		 332 aa  64.7  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  29.63 
 
 		 283 aa  64.3  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  29.25 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  27.82 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  29.85 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  28.76 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  31.25 
 
 		 282 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  29.93 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  30.61 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  35.58 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  32.81 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>