More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2091 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  64.44 
 
 		 181 aa  251  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 196 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  66.29 
 
 		 201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  67.63 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  65.14 
 
 		 182 aa  237  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  64.09 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  64.09 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  63.48 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  63.43 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  62.64 
 
 		 198 aa  225  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  60.34 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  59.77 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  59.77 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  59.77 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  59.77 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  59.77 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  59.77 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  59.2 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  59.2 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  58.93 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  56 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 195 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  56.29 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  55.95 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  52.87 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  49.43 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  53.22 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 		 173 aa  184  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  53.22 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  53.22 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  53.22 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  52.07 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  53.25 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  45.4 
 
 		 181 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  45.29 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 		 157 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  50.59 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  47.85 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  45.14 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  53.25 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  53.28 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  38.15 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  26.74 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  40.59 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  34.69 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  31.94 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  48.75 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  30.67 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  33.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.12 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>