More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1676 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  99.45 
 
 
182 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  81.77 
 
 
182 aa  315  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  75.82 
 
 
198 aa  291  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  74.59 
 
 
201 aa  287  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  75.14 
 
 
196 aa  287  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  75.42 
 
 
181 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  75.86 
 
 
183 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  70.43 
 
 
187 aa  266  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  64.09 
 
 
181 aa  236  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  60.11 
 
 
181 aa  225  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  61.71 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  60 
 
 
177 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  61.14 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  60.57 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  60.57 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  60.57 
 
 
198 aa  214  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  60.57 
 
 
198 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  61.14 
 
 
181 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  61.14 
 
 
181 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  61.14 
 
 
181 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  60.57 
 
 
181 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  60 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  60.71 
 
 
186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  58.89 
 
 
195 aa  209  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
194 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  59.43 
 
 
181 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  58.89 
 
 
195 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  58.89 
 
 
195 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 
173 aa  201  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  54.86 
 
 
182 aa  198  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  52.05 
 
 
181 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  54.27 
 
 
183 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  51.79 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 
183 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
184 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  49.12 
 
 
183 aa  175  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  50.88 
 
 
183 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
185 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 
183 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
183 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
183 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  47.88 
 
 
187 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
185 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 
157 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  52.38 
 
 
184 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  45.12 
 
 
187 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  43.9 
 
 
187 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  40 
 
 
187 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  40 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  39.18 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
187 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
187 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
187 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  28.16 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  30 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  30.67 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
200 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
265 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.9 
 
 
144 aa  61.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 
177 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
187 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  25.28 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  33.09 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>