More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2017 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  73.66 
 
 		 201 aa  297  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  74.32 
 
 		 196 aa  292  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  75.14 
 
 		 181 aa  288  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  75.86 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  75.86 
 
 		 182 aa  280  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  75.86 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  70.81 
 
 		 187 aa  264  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  68.57 
 
 		 198 aa  258  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  63.48 
 
 		 181 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  64.29 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  60.71 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  59.17 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  57.56 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  58.93 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 181 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 181 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 181 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 		 194 aa  203  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 		 195 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  58.01 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  56.91 
 
 		 195 aa  200  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  56.11 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  54.8 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  52.98 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  54.27 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  51.5 
 
 		 173 aa  180  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  52.38 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  51.45 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  50 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  48.47 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  49.13 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  53.57 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  42.05 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  31.54 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  30.87 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  32.43 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.43 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.43 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.43 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  31.51 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>