More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0537 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  33.53 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  33.95 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  35 
 
 		 177 aa  97.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  31.55 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  30.29 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  32.18 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  31.61 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  31.06 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  31.48 
 
 		 195 aa  88.2  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  32.1 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  35.58 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  33.65 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  27.88 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  26.09 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>