More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1988 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  74.16 
 
 
177 aa  280  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  72.62 
 
 
192 aa  262  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  70.59 
 
 
187 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  70.93 
 
 
177 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  70 
 
 
187 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  71.76 
 
 
189 aa  258  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  60.5 
 
 
200 aa  248  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  67.43 
 
 
180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 
178 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.71 
 
 
183 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  58.29 
 
 
176 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.71 
 
 
209 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.71 
 
 
183 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.71 
 
 
209 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.71 
 
 
209 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.71 
 
 
183 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  57.71 
 
 
183 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  58.29 
 
 
176 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
178 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  57.39 
 
 
178 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 
178 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 
178 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  57.39 
 
 
178 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  57.39 
 
 
178 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.68 
 
 
184 aa  205  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  56.63 
 
 
194 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  54.91 
 
 
193 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  54.91 
 
 
193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  52.41 
 
 
193 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  54.22 
 
 
198 aa  185  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  31.47 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  39.13 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  37.29 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  43.27 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
171 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  34.75 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
317 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  34.75 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
341 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  41.94 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 
314 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
163 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
305 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
278 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
286 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  27.35 
 
 
289 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
298 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  32 
 
 
314 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  33.05 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
317 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  33.7 
 
 
282 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  27.27 
 
 
272 aa  62.4  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
289 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>