More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1603 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  100 
 
 
164 aa  337  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  68.9 
 
 
171 aa  246  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  67.28 
 
 
164 aa  233  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  64.6 
 
 
177 aa  220  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 
184 aa  210  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  59.88 
 
 
171 aa  210  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  61.49 
 
 
170 aa  206  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
178 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  38.19 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
193 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
187 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  39.55 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  40.15 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
198 aa  73.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
265 aa  73.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
198 aa  70.9  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  32.98 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.55 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.55 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  39.55 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.55 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.55 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.55 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.55 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.22 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  30 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  30 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.06 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 
198 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  33.93 
 
 
137 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  34.29 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33 
 
 
139 aa  62  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
187 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
187 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  30.14 
 
 
187 aa  60.8  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
169 aa  60.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
135 aa  60.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
236 aa  59.7  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  35.58 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 
229 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  27.91 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  27.91 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.91 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>