More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2130 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  40.83 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 163 aa  131  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  39.8 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  37.62 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  36.97 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  48.44 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  48.44 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  36.94 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  33.15 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  48.44 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  35.16 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  30.11 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  28.41 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  35.83 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 320 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  43.48 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  30.65 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  37.37 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.65 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 200 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  30.69 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>