More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0882 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  94.44 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  40.39 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  38.65 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 179 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 181 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  34.07 
 
 		 171 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 189 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  31.38 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 187 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 177 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  33.52 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  33.52 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  32.8 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  28.27 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 195 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.3 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  28.42 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  27.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  26.63 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  26.37 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  27.03 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  25.27 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  27.07 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  26.2 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  25.13 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  24.59 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 		 239 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  27.8 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  26.7 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  23.38 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  23.38 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  26.15 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  28.8 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  23.71 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.69 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  28.12 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  26.6 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.27 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>