269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 
199 aa  315  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  75.76 
 
 
210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  75.76 
 
 
199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  74.87 
 
 
199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  74.75 
 
 
199 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  75.63 
 
 
203 aa  298  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  74.62 
 
 
203 aa  295  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  76 
 
 
201 aa  295  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  72.02 
 
 
198 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  72.02 
 
 
198 aa  287  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 
195 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 
207 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  45.45 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 
222 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  45.75 
 
 
199 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  45.75 
 
 
199 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  45.75 
 
 
199 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
223 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  38.64 
 
 
192 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  42.21 
 
 
192 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  42.21 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  42.21 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
242 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  42.21 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  42.21 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  45.91 
 
 
226 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  45.91 
 
 
227 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  42.86 
 
 
217 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
243 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  44.23 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.91 
 
 
197 aa  118  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  37.91 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  38.07 
 
 
192 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 
237 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
327 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
187 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
177 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  41.21 
 
 
227 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  34.27 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  39.29 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  39.66 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
199 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
210 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
245 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  41.95 
 
 
202 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
197 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
226 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
239 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 
171 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
192 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  40.34 
 
 
192 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  42.38 
 
 
199 aa  104  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  40.34 
 
 
192 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
195 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  40.34 
 
 
192 aa  104  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  40.34 
 
 
192 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  40.34 
 
 
192 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
244 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
195 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
195 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
207 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  38.32 
 
 
168 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  38.32 
 
 
168 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
235 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
201 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
199 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
192 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  39.38 
 
 
195 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  43.51 
 
 
192 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
191 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  40.34 
 
 
192 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
211 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
196 aa  101  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.25 
 
 
199 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
194 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 
210 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
197 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
234 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
228 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
233 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 
427 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
234 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 
195 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>