262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2018 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  73.76 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  72.97 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  72.43 
 
 		 197 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  63.39 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  63.16 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  63.16 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  63.16 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  55.56 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  56.04 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  56.04 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  56.04 
 
 		 192 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  56.04 
 
 		 192 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  56.04 
 
 		 192 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  58.79 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  58.79 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  58.79 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  58.79 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  58.79 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  58.24 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 192 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  58.24 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  58.79 
 
 		 192 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  49.35 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 227 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  43.9 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  43.83 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  41.46 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  41.46 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  43.21 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  33.84 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  38.59 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  38.59 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  32.14 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  37.16 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 244 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  36.7 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.95 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.57 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 333 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  36.23 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 483 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 427 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 427 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  40.37 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 235 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  40.49 
 
 		 227 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>