266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1406 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  68.75 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  68.78 
 
 		 222 aa  325  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  68.44 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  69.12 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  65.5 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  65.25 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  62.27 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  56.83 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  65.02 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.38 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  50.89 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.47 
 
 		 483 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.02 
 
 		 427 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  53.74 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  51.57 
 
 		 427 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.02 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  49.79 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.31 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.31 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.27 
 
 		 199 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  50.21 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  45.02 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  51.23 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  53.7 
 
 		 168 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  51.43 
 
 		 211 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  53.7 
 
 		 168 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  52.47 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  49.39 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  56.79 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  54.27 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  46.01 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 195 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 195 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  43.56 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  42.86 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  44.58 
 
 		 267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  43.04 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  37.85 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  37.85 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  37.85 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 201 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  42.41 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  42.41 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  43.04 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  40.74 
 
 		 192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 		 204 aa  118  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 		 195 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.31 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  40.25 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  40.25 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  40.25 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  40.25 
 
 		 192 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  40.25 
 
 		 192 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  38.32 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>