263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0879 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  97.01 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  81.25 
 
 		 202 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  65.09 
 
 		 226 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  61.64 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  57.94 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  57.94 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  58.37 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  58.37 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  58.37 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  58.37 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  58.16 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  57.08 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.41 
 
 		 427 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.56 
 
 		 427 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.56 
 
 		 483 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.56 
 
 		 333 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.65 
 
 		 347 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  54.96 
 
 		 242 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.36 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.36 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  57.33 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.52 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  50.87 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  49.79 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  46.64 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  57.4 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  45.02 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  51.14 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  47.03 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  46.86 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  46.12 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  44.89 
 
 		 168 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  44.89 
 
 		 168 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  44.13 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.61 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  42.01 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  39.3 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  42.01 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  42.94 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  45.88 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  40.8 
 
 		 197 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  41.42 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  45.74 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  39.41 
 
 		 204 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  42.11 
 
 		 191 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 194 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 200 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.35 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  38.28 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  38.28 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  38.28 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  38.28 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  42.44 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1942  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000158411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  37.8 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2377  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000154779  normal  0.335752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1949  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112365  normal  0.784908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1916  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  40.8 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  36.82 
 
 		 197 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>