263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1929 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  95.43 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  71.74 
 
 		 217 aa  265  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  72.97 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  61.5 
 
 		 192 aa  240  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  61.19 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  61.19 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  61.19 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  60.43 
 
 		 192 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  59.89 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  59.89 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  59.89 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  59.89 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  61.17 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  61.17 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  61.17 
 
 		 192 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  61.17 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  61.17 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  61.17 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  61.17 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  60.64 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  61.17 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  45.73 
 
 		 226 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  45.73 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  40.62 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  45.73 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  42.33 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  42.33 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  36.08 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  39.89 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  37.81 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 242 aa  121  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.59 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  37.63 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 234 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  39.18 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  38.66 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.82 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.03 
 
 		 267 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.56 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  40.21 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 233 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  39.44 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 483 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 333 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 427 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.12 
 
 		 427 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>