258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3409 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  82.41 
 
 		 199 aa  334  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  78.89 
 
 		 203 aa  321  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  78.89 
 
 		 203 aa  321  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  78 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  78.28 
 
 		 210 aa  317  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 		 199 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 		 199 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  78.97 
 
 		 198 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  77.44 
 
 		 198 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  76 
 
 		 200 aa  295  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  47.94 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  42.05 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  42.05 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  42.05 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 244 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  44.52 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  40.33 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  39.78 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  39.78 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  39.78 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  39.78 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  39.23 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  42.21 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  38.54 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  38.97 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.95 
 
 		 267 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 244 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  38.79 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  41.81 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  34.07 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 239 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.63 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 		 483 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.63 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.63 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 		 427 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 		 427 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 327 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  39.08 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 189 aa  98.2  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 		 347 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.24 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>