249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0464 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 327 aa  670    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2125  NUDIX hydrolase  67.01 
 
 		 245 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1840  MutT/nudix family protein  66.49 
 
 		 245 aa  278  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  37.21 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 198 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 200 aa  112  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  39.88 
 
 		 203 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  39.53 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 207 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 199 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 199 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 210 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 199 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 199 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 178 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 201 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  37.22 
 
 		 192 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 242 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  38.18 
 
 		 217 aa  95.9  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  32.56 
 
 		 227 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 200 aa  93.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.9 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  34.39 
 
 		 192 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  34.25 
 
 		 192 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  34.25 
 
 		 192 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 195 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  34.25 
 
 		 192 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  45.45 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  34.25 
 
 		 192 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 195 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  44.95 
 
 		 203 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.31 
 
 		 483 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 		 198 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.31 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.31 
 
 		 217 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.31 
 
 		 217 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.71 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.31 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  36.59 
 
 		 199 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  36.59 
 
 		 199 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 244 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  36.59 
 
 		 199 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  47.25 
 
 		 242 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 235 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 189 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 228 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  33.52 
 
 		 192 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 228 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 228 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 228 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 195 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  38.79 
 
 		 197 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 228 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 237 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 198 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 243 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 233 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  32.78 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  33.53 
 
 		 168 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  33.53 
 
 		 168 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  30.67 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  30.97 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  31.71 
 
 		 202 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  31.22 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 210 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.21 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>