266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3351 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  99.55 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  69.07 
 
 		 243 aa  324  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  69.49 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  68.75 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  63.32 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  62.61 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  65 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  69.96 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  55.95 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.39 
 
 		 427 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.39 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.95 
 
 		 427 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.95 
 
 		 483 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.56 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.74 
 
 		 347 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.56 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  58.08 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  52.23 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  52.34 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  53.88 
 
 		 235 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  49.78 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  50.22 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  49.79 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  52.26 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  54.75 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  47.72 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  50.27 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  48.22 
 
 		 221 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  54.72 
 
 		 168 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  54.72 
 
 		 168 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  47.21 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  53.46 
 
 		 207 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  51.83 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  54.94 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  54.82 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  51.27 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  54.72 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  59.12 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  46.19 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  48.35 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  47.43 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  52.44 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  55.13 
 
 		 233 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  45.18 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  54.66 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  50.62 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  49.09 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  43.3 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  45.34 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  44.04 
 
 		 203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  44.1 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 204 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  44.59 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  41.25 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  42.77 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  43.06 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 189 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  37.36 
 
 		 199 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  37.36 
 
 		 199 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  37.36 
 
 		 199 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  39.38 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  38.27 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  42.94 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>