272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1199 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 198 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  43.75 
 
 		 198 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 199 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 201 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  39.38 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  37.13 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  35.22 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 243 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 197 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 195 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  39.35 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  38.99 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.59 
 
 		 199 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  35.22 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  39.53 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 228 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1840  MutT/nudix family protein  38.51 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 244 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2125  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 245 aa  104  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  34.78 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.49 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.49 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  40.28 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  40.28 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  37.35 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  40.28 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.49 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 234 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 235 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  36.2 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  37.65 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 483 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 427 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 427 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  35.88 
 
 		 267 aa  99.4  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.04 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.24 
 
 		 333 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 327 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.88 
 
 		 347 aa  98.6  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.9 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 235 aa  97.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  36.81 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  37.87 
 
 		 192 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  37.87 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 227 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 226 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  38.12 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  38.65 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  38.12 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  38.12 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 202 aa  94.4  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 195 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 194 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 227 aa  94  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 195 aa  94  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.27 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>