261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2450 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  66.32 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  61.19 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  62.63 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  62.43 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  63.16 
 
 		 203 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  55.26 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  55.26 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  55.26 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  55.26 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  55.26 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  54.45 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  57.37 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  57.37 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  57.37 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  57.37 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  57.37 
 
 		 192 aa  197  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  56.84 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  57.37 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  57.37 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  56.84 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.82 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  38.1 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 		 198 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  42.2 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  40.84 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  43.87 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  45.75 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  40.36 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  40.36 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  37.17 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  35.6 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  37.44 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 195 aa  121  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  44.24 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  44.51 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  39.79 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.89 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 228 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.72 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  41.38 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.72 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 244 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.72 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.72 
 
 		 333 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.33 
 
 		 483 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.36 
 
 		 427 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.36 
 
 		 427 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 228 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  47.2 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.72 
 
 		 347 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  38.29 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  37.58 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>