266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3526 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  97.08 
 
 		 177 aa  345  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  64.09 
 
 		 194 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  61.31 
 
 		 171 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  40.78 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  39.26 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 243 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 		 223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 226 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  38.67 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 245 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  40.38 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 227 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  37.28 
 
 		 227 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  42.14 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 483 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 427 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 333 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  41.03 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  41.03 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  41.03 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.46 
 
 		 427 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 242 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  36.97 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 219 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 235 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  36.88 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.5 
 
 		 347 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>