262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1295 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  83.04 
 
 		 230 aa  384  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  44.13 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 		 211 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  42.07 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.87 
 
 		 197 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  33.13 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  35.71 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  41.07 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  37.42 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  37.42 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  42.13 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.18 
 
 		 427 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 197 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 190 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.01 
 
 		 483 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.01 
 
 		 427 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 189 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.43 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.15 
 
 		 333 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.43 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.43 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 189 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 198 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 199 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 195 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 347 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  37.58 
 
 		 273 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  39.62 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  35.8 
 
 		 195 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.1 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  34.81 
 
 		 195 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  39.07 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  36.99 
 
 		 192 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  35.33 
 
 		 198 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 199 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  39.02 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  38.85 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>