254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0521 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  60.89 
 
 		 203 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  57.79 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  57.14 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  51.98 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  54.5 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  55.39 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  51.98 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  56.63 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  56.74 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  53.37 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  51.4 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 213 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  52.66 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  53.71 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  56.14 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  49.73 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  52.91 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 		 223 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  47.46 
 
 		 212 aa  142  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  50.81 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  50.96 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  36.53 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  41.52 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  35.19 
 
 		 199 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 200 aa  88.6  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.87 
 
 		 197 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  34.52 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 191 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.07 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  40.14 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  43.09 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  36.99 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  35.98 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  35.98 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.09 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.67 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>