237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09303 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  49.76 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  34.76 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  34.97 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.87 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.52 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  34.55 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  28.65 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  27.59 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  32.52 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  29.24 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  32.09 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  28.29 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  34.38 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.19 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.19 
 
 		 483 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.19 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.19 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.19 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  29.73 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  30.17 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.19 
 
 		 427 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  27.65 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  27.86 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.57 
 
 		 427 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  28.03 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  31.68 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  26.09 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>