241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1375 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  87.31 
 
 
260 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  75.1 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  75.1 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  75.1 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  68.42 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  45.82 
 
 
291 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
234 aa  161  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
234 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  46.24 
 
 
225 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
231 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
230 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
213 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  40.24 
 
 
229 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  44.75 
 
 
221 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  45.6 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  47.27 
 
 
237 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  39.91 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 
203 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
217 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  38.59 
 
 
213 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
239 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
231 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  42.63 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
215 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 
202 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
207 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  34.5 
 
 
199 aa  92  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  38.2 
 
 
168 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  34.24 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  38.2 
 
 
168 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
226 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
227 aa  89  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.88 
 
 
199 aa  85.5  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
223 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  33.87 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  33 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
221 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  31.8 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  35.18 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.76 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  32 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  37.33 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.51 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  33 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
216 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  35.1 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  33.1 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  34.48 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  36.43 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  28.78 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  32.95 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  32.95 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  32.95 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.63 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  32 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>