267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0721 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  100 
 
 
234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  61.02 
 
 
229 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  54.07 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  57.99 
 
 
203 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  52.88 
 
 
278 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  51.98 
 
 
254 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  54.02 
 
 
246 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  50.47 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  50.93 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  50.72 
 
 
230 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  49.27 
 
 
239 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  51.94 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  48.06 
 
 
213 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 
239 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  44.59 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 
215 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  55.62 
 
 
217 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  43.39 
 
 
259 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
291 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
260 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 
213 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
260 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
231 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 
225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  53.16 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  44.98 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 
233 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  47.57 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  41.1 
 
 
168 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  41.1 
 
 
168 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  39.76 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  40 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  31.4 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  30.99 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
214 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.55 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
189 aa  79  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
191 aa  79  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  36.81 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.37 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  33.71 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  32.95 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_6789  predicted protein  38.52 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.25 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>