More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 291 aa  148  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  44.13 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  43.4 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  43.19 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  43.32 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  44.13 
 
 		 278 aa  131  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 300 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  42.86 
 
 		 269 aa  121  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  40.91 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 		 217 aa  111  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  41.3 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 231 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  30.73 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  34.57 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.9 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  34.57 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  28.27 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.72 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  43.81 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  36.57 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  38.42 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  28.73 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.13 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30.86 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  35.36 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  35.36 
 
 		 192 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.53 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.03 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  37.85 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.53 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  35.36 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  35.36 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.03 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.03 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.12 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>