More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2236 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  55.66 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  63.98 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  55.61 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  61.49 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  59.26 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  59.12 
 
 		 244 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  59.12 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  54.94 
 
 		 168 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  54.94 
 
 		 168 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  52.8 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  50.78 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  51.89 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  54.22 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  49.2 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  56.79 
 
 		 242 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  49.2 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  54.49 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  49.2 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  53.23 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  47.78 
 
 		 347 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  52.53 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  54.22 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  56.16 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.76 
 
 		 427 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.76 
 
 		 483 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.41 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.41 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.76 
 
 		 333 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.41 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  52.15 
 
 		 427 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  51.83 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  50.57 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  47.28 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  51.19 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  49.38 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 245 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  45.85 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  45.79 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  48.91 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  41.82 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  45.34 
 
 		 195 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  45.34 
 
 		 195 aa  141  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  44.19 
 
 		 190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  47.47 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  45.22 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  40.99 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 195 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  42.77 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  38.27 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  39.57 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  35.4 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2009  NUDIX hydrolase  48.43 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.958398  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1949  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112365  normal  0.784908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>