286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1888 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1888  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  67.63 
 
 		 244 aa  314  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  64.49 
 
 		 243 aa  308  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  69.51 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  63.93 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  64.76 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  57.87 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  58.95 
 
 		 235 aa  269  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  64.63 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  53.3 
 
 		 227 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  56.64 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  51.54 
 
 		 427 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  51.1 
 
 		 427 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  51.1 
 
 		 333 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  51.57 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  50.66 
 
 		 483 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  51.12 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  50.88 
 
 		 347 aa  214  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  49.78 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  49.78 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  49.78 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  49.78 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  51.85 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  51.85 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  51.1 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  49.79 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  53.81 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  47.11 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  46.12 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  46.12 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  58.13 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  49.25 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  52.91 
 
 		 168 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  52.91 
 
 		 168 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  55.95 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  42.92 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  46.19 
 
 		 207 aa  158  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  49.38 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 214 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 194 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 216 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  50.6 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  51.7 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  51.9 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  40.41 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  35.42 
 
 		 199 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 195 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  49.7 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.95 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  41.04 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  38.6 
 
 		 195 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 189 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  45.51 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  43.9 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.88 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 199 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  43.45 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  43.45 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  43.45 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  43.45 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  43.45 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 189 aa  118  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  41.81 
 
 		 199 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  41.81 
 
 		 199 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  41.81 
 
 		 199 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  40.24 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  33.82 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  43.9 
 
 		 192 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  41.98 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>