252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0110 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  46.63 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  46.63 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  47.8 
 
 		 223 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  45.68 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  45.68 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  45.68 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  49.35 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  47.2 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  45.73 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  47.77 
 
 		 217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  47.74 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 216 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  40.33 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  45.81 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  45.57 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  45.16 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 235 aa  121  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  40.33 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  41.83 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  41.99 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  41.56 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  45 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  39.75 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  43.4 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 483 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.1 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 333 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 427 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  41.94 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  41.94 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.5 
 
 		 427 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  41.94 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  41.94 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  41.94 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  40.91 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  41.18 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.02 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  40.1 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 234 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  39.87 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  46.95 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.25 
 
 		 347 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>