262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1364 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  98.52 
 
 
203 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  80.2 
 
 
199 aa  324  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  78.89 
 
 
201 aa  321  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  75.88 
 
 
210 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  76.65 
 
 
199 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  78.12 
 
 
198 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  77.08 
 
 
198 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  75.76 
 
 
199 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  76.65 
 
 
199 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  75.63 
 
 
200 aa  298  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 
195 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
207 aa  188  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  43.3 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 
222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  43.83 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 
178 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
242 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  39.67 
 
 
192 aa  121  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 
243 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  44.51 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  44.51 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  41.56 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  44.51 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
235 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  39.34 
 
 
192 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 
227 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  38.66 
 
 
197 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  37.77 
 
 
192 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  44.94 
 
 
267 aa  114  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
223 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.44 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
327 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
239 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  42.37 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
210 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
199 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
244 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  35.75 
 
 
227 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  32.58 
 
 
197 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
207 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
197 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
245 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
234 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
234 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
189 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1840  MutT/nudix family protein  35.16 
 
 
245 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 
226 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
192 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
200 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 
177 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  36.81 
 
 
168 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
214 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
199 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
194 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  36.81 
 
 
168 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 
225 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2125  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
211 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
187 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  37.2 
 
 
202 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  39.38 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 
427 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
233 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  38.27 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.63 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 
483 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.63 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 
333 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.63 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.39 
 
 
427 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.01 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
228 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>