265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3375 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  72.35 
 
 		 194 aa  257  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  61.31 
 
 		 187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  59.88 
 
 		 177 aa  204  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  50 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 189 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 226 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 241 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 198 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 199 aa  120  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 196 aa  120  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 245 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 223 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 197 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  39.24 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  43.71 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  38.41 
 
 		 199 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.56 
 
 		 267 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 207 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.91 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  38.65 
 
 		 217 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.34 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  35.12 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  36.75 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 219 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  37.11 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  35.44 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  37.97 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  37.97 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  34.44 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  37.97 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.07 
 
 		 216 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 207 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 222 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  37.66 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 210 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 239 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 228 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.38 
 
 		 285 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.52 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  39.62 
 
 		 198 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 198 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 233 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  35.84 
 
 		 238 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 244 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>