264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2809 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  66.32 
 
 
199 aa  261  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  66.32 
 
 
199 aa  261  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  66.32 
 
 
199 aa  261  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  66.67 
 
 
197 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  67.76 
 
 
197 aa  248  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  63.83 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  63.39 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  63.98 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  63.04 
 
 
192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  215  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  215  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  215  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  63.04 
 
 
192 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  62.5 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  63.59 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  63.59 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
226 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
227 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  36.79 
 
 
199 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  38.54 
 
 
204 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  37.77 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
189 aa  134  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  41.36 
 
 
199 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  40.64 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  43.89 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  40.62 
 
 
190 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
243 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  41.46 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  40.12 
 
 
168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  40.12 
 
 
168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
244 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
222 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 
242 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
199 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
207 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
191 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
199 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
197 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
210 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
211 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.78 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.56 
 
 
483 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
201 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.78 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.78 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.78 
 
 
333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.5 
 
 
267 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.78 
 
 
427 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  37.99 
 
 
198 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.78 
 
 
427 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
214 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  40.36 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  44.57 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.04 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
228 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
234 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
234 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
200 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
228 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
199 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  37.77 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
228 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
228 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  37.77 
 
 
203 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  37.7 
 
 
227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5174  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>