268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2642 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  54 
 
 
199 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  49.49 
 
 
203 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 
198 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  53 
 
 
210 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  53 
 
 
199 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  50.78 
 
 
198 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  48.99 
 
 
203 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
199 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  51.55 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  47.94 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 
200 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 
195 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  47.56 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  47.56 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  47.56 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  47.56 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 
243 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.75 
 
 
483 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  46.41 
 
 
203 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.75 
 
 
427 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.5 
 
 
427 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  44.26 
 
 
192 aa  131  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.75 
 
 
333 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  43.89 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.75 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.75 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  48.75 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 
228 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
228 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  39.55 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
222 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 
244 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 
243 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  46.88 
 
 
347 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
226 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
227 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  45.51 
 
 
238 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  35.03 
 
 
204 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  46.5 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  44.63 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  42.21 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  44.63 
 
 
192 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  44.63 
 
 
192 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  44.63 
 
 
192 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  43.04 
 
 
227 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  44.63 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
245 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 
192 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  44.63 
 
 
192 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  40.53 
 
 
239 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  43.21 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  41.56 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  46.05 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  44.07 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
207 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
221 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
200 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
234 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
235 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.08 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  41.77 
 
 
191 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.21 
 
 
267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.66 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  40 
 
 
202 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
197 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
197 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
211 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>