262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1058 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  98.49 
 
 		 210 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  97.49 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  96.46 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  85.93 
 
 		 199 aa  357  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  84.62 
 
 		 198 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  83.59 
 
 		 198 aa  340  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 		 201 aa  315  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  76.65 
 
 		 203 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  74.75 
 
 		 200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  75.13 
 
 		 203 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  54 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 195 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  45.06 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  45.06 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  45.06 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  42.37 
 
 		 192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  42.37 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  42.37 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  42.37 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  42.37 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  41.81 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  44.16 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  43.72 
 
 		 243 aa  121  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  42.21 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  38.25 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.03 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.16 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 177 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01783  predicted NUDIX hydrolase  43.5 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01771  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  36.96 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  38.55 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1375  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431722  normal  0.0201503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2542  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1903  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2074  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  41.95 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2041  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.767004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1830  NUDIX hydrolase  43.5 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1820  hypothetical protein  43.5 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.288168  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 327 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  41.18 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  38.99 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  40.51 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  38.86 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.36 
 
 		 427 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.76 
 
 		 483 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.76 
 
 		 333 aa  97.8  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.76 
 
 		 427 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>