296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0115 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  100 
 
 
201 aa  390  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 
199 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 
243 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
245 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
226 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
214 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  45.4 
 
 
227 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 
211 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
195 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  43.37 
 
 
168 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  43.37 
 
 
168 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
207 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 
198 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 
207 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 
235 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  45.91 
 
 
220 aa  117  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  42.06 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 
239 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  39.23 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.67 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.44 
 
 
427 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  43.86 
 
 
333 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  43.86 
 
 
483 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 
228 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
221 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  43.86 
 
 
427 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.29 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.29 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  43.86 
 
 
199 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  43.29 
 
 
190 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 
228 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
197 aa  111  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 
235 aa  111  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
228 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
228 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  43.72 
 
 
228 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 
228 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  44.06 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 
347 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  40 
 
 
189 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
200 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  41.72 
 
 
195 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  41.51 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
216 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  39.7 
 
 
195 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  39.38 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
197 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 
235 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
189 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
191 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
198 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  41.45 
 
 
202 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  42.51 
 
 
192 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2009  NUDIX hydrolase  48 
 
 
197 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.958398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
195 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
195 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
200 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
219 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 
204 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
195 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
199 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
226 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 
219 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
189 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  38.01 
 
 
195 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
178 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  41.4 
 
 
217 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
221 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
199 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
234 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
210 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
234 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.06 
 
 
218 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
177 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
216 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
187 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  37.04 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  35.11 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
237 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>