272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1265 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  100 
 
 
183 aa  376  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
243 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
196 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  34.94 
 
 
203 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.5 
 
 
197 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
245 aa  99  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  32.75 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  36.88 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
221 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  36.75 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  36.75 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
242 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
220 aa  94.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
207 aa  94.4  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
225 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  30.43 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
178 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
201 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  32.16 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
221 aa  91.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
214 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
226 aa  91.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
244 aa  91.3  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
197 aa  90.9  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  32.05 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  32.05 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  32.05 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
198 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
227 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  31.9 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.72 
 
 
199 aa  89  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
216 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
201 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  31.14 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
197 aa  87.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
210 aa  87.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  30 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  28.93 
 
 
267 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.72 
 
 
204 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  32.58 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  31.41 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
237 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0164  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410349  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
243 aa  85.1  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  34 
 
 
288 aa  85.1  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
234 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
235 aa  84.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
200 aa  84.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
234 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  30.67 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  30.06 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  32.76 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  32.58 
 
 
202 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
233 aa  82  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
230 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>