246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2393 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  100 
 
 
216 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  49.76 
 
 
213 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
213 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
241 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.29 
 
 
197 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
219 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 
231 aa  95.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  34.52 
 
 
202 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  35.98 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.02 
 
 
204 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
223 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  32.39 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
300 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
278 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  36.48 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
183 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
198 aa  88.6  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
188 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.73 
 
 
427 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
244 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
189 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
246 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  28.33 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.12 
 
 
333 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.12 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.12 
 
 
483 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.12 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.12 
 
 
427 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.12 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 
178 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  28.33 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  31.22 
 
 
199 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
228 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  33.89 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  27.57 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  34.57 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  34.57 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  29.48 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
243 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  31.55 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.75 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  34.46 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  30 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  29.19 
 
 
267 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
195 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  35.14 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>