254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4290 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  60.73 
 
 		 278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  51.71 
 
 		 230 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  52.2 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  52.45 
 
 		 213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  54.59 
 
 		 221 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 213 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  51.6 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 		 203 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  55.02 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  50.93 
 
 		 234 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  54.15 
 
 		 215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  52.61 
 
 		 246 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  51.93 
 
 		 213 aa  165  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 225 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  50.53 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  39.91 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 231 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  43.89 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  43.89 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  43.89 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  45.6 
 
 		 237 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  43.39 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  40.74 
 
 		 212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  39.17 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 226 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 227 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 227 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 200 aa  92.4  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 223 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  40.62 
 
 		 190 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 228 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 216 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 228 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 228 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 226 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 189 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 214 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 197 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.93 
 
 		 199 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 216 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 198 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  40.72 
 
 		 202 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 207 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 221 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 189 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 211 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.62 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  40.14 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.04 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  47.24 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.04 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.04 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  39.61 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  38.78 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.04 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.04 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.04 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 189 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>