263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0206 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  72.64 
 
 		 213 aa  278  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  59.15 
 
 		 221 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  59.66 
 
 		 278 aa  201  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  54.15 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  61.45 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  53.71 
 
 		 254 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  49.77 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  57.46 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  51.93 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  51.05 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 213 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  48.02 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  48.44 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  51.2 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  42.52 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  42.63 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 291 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  45.75 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 260 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  38.1 
 
 		 168 aa  91.7  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  38.1 
 
 		 168 aa  91.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  32.28 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  35.65 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  36.75 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.65 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  42.4 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  40.49 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  40.49 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  40.49 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  33.95 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  40.49 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  40.49 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>