265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 237 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  53.98 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  53.4 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  49.36 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  51.65 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  48.02 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 		 203 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  49.5 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  47.85 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  50.26 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  49.47 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  46.96 
 
 		 273 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 278 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  47.03 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  48.73 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  47.03 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  41.21 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.21 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  43.59 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.14 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 195 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 195 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 195 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.37 
 
 		 191 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 191 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.88 
 
 		 190 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.14 
 
 		 195 aa  88.6  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.98 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 189 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  30.14 
 
 		 202 aa  85.9  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.54 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  32.95 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  38.41 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  38.41 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  37.71 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>