207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  100 
 
 
237 aa  454  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
213 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
300 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  41.3 
 
 
212 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  38.34 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  43.59 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 
254 aa  95.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  40 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 
278 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
233 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
225 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
231 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  38.67 
 
 
213 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
189 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  36.6 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  40.76 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  36.6 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  38.69 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
214 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  32.09 
 
 
199 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  34.46 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  34.46 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  34.46 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  32.09 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.52 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  29.53 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  33.14 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  33.15 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  33.33 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.33 
 
 
347 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  30.41 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  35.15 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.41 
 
 
427 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  33.52 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  26.88 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
177 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  32.2 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  31.95 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.87 
 
 
483 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.87 
 
 
427 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
187 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.87 
 
 
333 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  32.39 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  33.76 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>