More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0815 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  45.57 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 204 aa  100  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 231 aa  96.3  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 241 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 230 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 243 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  43.29 
 
 		 221 aa  90.9  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  37.87 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  34.42 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  40.24 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  37.85 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  37.89 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.29 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  36.56 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 226 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 234 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  39.62 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  40.37 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 244 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  40.37 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  40.37 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  40.37 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 245 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  36.88 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  54.08 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 216 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.12 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.96 
 
 		 267 aa  84.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  36.02 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.65 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  29.21 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  52.81 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  41.56 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  40.37 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  41.71 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  34.84 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 278 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  41.21 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  51.58 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>