267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0533 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
202 aa  167  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  43.26 
 
 
214 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.39 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.92 
 
 
216 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
179 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
196 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
246 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
181 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
221 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  28.72 
 
 
171 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  32.94 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1964  MutT/nudix family protein  38.3 
 
 
163 aa  90.1  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
194 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 
187 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  28.02 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 
245 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  28.82 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  27.8 
 
 
193 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  27.68 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  25.57 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  31.14 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  27.68 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  27.65 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  23.16 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  22.93 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  25.53 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  25.28 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  25.63 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  22.93 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  24.87 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  26.97 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0110  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04219  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.98 
 
 
427 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.15 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  30 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4264  NUDIX hydrolase  29.02 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.98705  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  24.31 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  21.95 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.15 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.98 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.81 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.81 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.81 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  24.31 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  26.01 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0164  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410349  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  24.51 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  24.29 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  26.97 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  26.97 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  33.63 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>