244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1032 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.65 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.21 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  34.44 
 
 		 171 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 181 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.51 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 		 177 aa  94.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  33.14 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  30.62 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 195 aa  88.2  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.82 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  27.84 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.83 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  31.16 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  28.02 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  27.72 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  28.02 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  30.58 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  27.75 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  30.14 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  33.15 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  33.16 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  35.34 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  35 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  25.29 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  26.78 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  30.35 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  29.89 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>