213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1568 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 187 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  32.58 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 194 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.09 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 177 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 196 aa  89  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  29.74 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.96 
 
 		 197 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  29.44 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  30.04 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  29.44 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 199 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 189 aa  85.1  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.49 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  25.91 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  29.08 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  30.93 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  26.94 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  30.93 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  26.77 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  27.52 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  27.35 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  25.11 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  27.8 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  30.14 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  30.14 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  26.8 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  27.46 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  26.64 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  26.92 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  26.92 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  28.21 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49040  predicted protein  28.71 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00913566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  26.92 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  29.21 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  24.62 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  27.98 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  28.5 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01490  conserved hypothetical protein  43.24 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  26.84 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  24.61 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  28.35 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  27.67 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  26.07 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 197 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  29.78 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1513  hypothetical protein  26.19 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  32 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  26.42 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  25.32 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>