More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0985 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  41.15 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  45.91 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  37.98 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  45.91 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  43.95 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  40.41 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.88 
 
 		 427 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.58 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.36 
 
 		 333 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.58 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.58 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.36 
 
 		 427 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.36 
 
 		 483 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  37.43 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  40.84 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  38.86 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  40.88 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  43.53 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  36.59 
 
 		 168 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  36.59 
 
 		 168 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.5 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  40.41 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.75 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  40.76 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.97 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  39.1 
 
 		 267 aa  95.5  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  42.24 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.53 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0164  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410349  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>