256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1211 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  44.13 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  48.52 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 		 194 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  43.56 
 
 		 171 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  43.2 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  43.75 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.22 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 483 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 427 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  40.85 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  40.85 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 333 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 427 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  44.97 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  36.75 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  45.4 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.42 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  37.27 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  43.53 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  41.4 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  42.01 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  43.11 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  41.4 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  41.4 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2236  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 216 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 189 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 195 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  39.88 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  40.61 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 196 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  38.86 
 
 		 192 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>