251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4757 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  100 
 
 
231 aa  447  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  93.04 
 
 
230 aa  417  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 
213 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  54.37 
 
 
278 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  52.2 
 
 
300 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  56.1 
 
 
213 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  58.72 
 
 
203 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  53.92 
 
 
229 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 
254 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  58.86 
 
 
239 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  50.47 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  54.45 
 
 
221 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  50.24 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
233 aa  161  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 
215 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 
234 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
259 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  42.86 
 
 
273 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 
259 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 
259 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
291 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  53.23 
 
 
269 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
260 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  45 
 
 
225 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  44.13 
 
 
212 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 
223 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  52.44 
 
 
237 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
225 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 
207 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  39.26 
 
 
168 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  39.26 
 
 
168 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  38.5 
 
 
196 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 
235 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  40.37 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 
242 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
243 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  40 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  40.12 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
427 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.18 
 
 
483 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.18 
 
 
427 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.41 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.41 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.41 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.18 
 
 
333 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.67 
 
 
202 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  41.89 
 
 
227 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  40 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
228 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
219 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
241 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  41.26 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
197 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
239 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.32 
 
 
199 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
201 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  48.15 
 
 
238 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 
216 aa  85.1  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  40.59 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.53 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.12 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>