More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0342 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  46.08 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
239 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
225 aa  175  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
213 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 
254 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
230 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  46.6 
 
 
213 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  44.12 
 
 
221 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
278 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
300 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  44.12 
 
 
269 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
246 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  41.98 
 
 
212 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  40 
 
 
291 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
231 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  48.19 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 
223 aa  138  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  36.05 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  46.74 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
215 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
260 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
259 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  37.26 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
259 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
259 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
233 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
231 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
245 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
189 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 
189 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  42.18 
 
 
168 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  42.18 
 
 
168 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  35.76 
 
 
190 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
190 aa  92.4  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
214 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.29 
 
 
197 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  42.39 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  35.85 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  36.51 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
189 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
195 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.71 
 
 
199 aa  88.6  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  32.28 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
196 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
427 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
195 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
195 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
427 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
196 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  35.68 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
483 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
204 aa  85.9  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
333 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.57 
 
 
199 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.58 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
228 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
227 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
201 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.99 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.57 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>